目的 采用生物信息学方法分析结核分枝杆菌的Rv1963c基因及其编码的Mce3R蛋白结构和功能。方法 自NCBI网站获取Rv1963c基因及Mce3R蛋白的基本信息;使用Protparam和ProtScale预测Mce3R蛋白的理化性质和亲疏水性;使用SignaIP4.1 Server、TMHMM Serverv.2.0和NetPhos3.1软件预测Mce3R蛋白的信号肽、跨膜结构及磷酸化位点;使用SOPMA预测Mce3R蛋白的二级结构,通过SWISS MODEL软件构建该蛋白的三级结构模型;分别使用IEDB和SYFPEITHI预测Mce3R蛋白的B和T细胞表位;通过STRING数据库预测Mce3R的相互作用蛋白。结果 Rv1963c基因全长1 221 bp,编码的Mce3R蛋白氨基酸数为406,分子式为C1948H3177N587O581S7;亲水性系数-0.132,预测其为亲水性蛋白。Mce3R蛋白含有磷酸化位点和抗原表位。结论 生物信息学方法分析Mce3R蛋白含有一个保守的结构域,其结构域与结核分枝杆菌耐药性的产生密切相关,为抗结核药物靶点的选择提供了新方向。预测Mce3R蛋白含有大量抗原表位,可能成为结核病疫苗的候选蛋白。