首页 / 院系成果 / 成果详情页

基于转录组测序和单细胞RNA测序探讨脑出血后神经损伤修复的关键基因和细胞通讯  期刊论文  

  • 编号:
    DB7898111B51CBB41A8FD713B42D7528
  • 作者:
    宋海涛#;宋仁兴*;赵千云;聂文;陈森;宋德文;潘峰;赵波
  • 地址:
    261000 潍坊,山东第二医科大学临床医学院;266300 青岛,同济大学附属东方医院胶州医院神经外科
  • 语种:
    中文
  • 期刊:
    中华细胞与干细胞杂志(电子版) ISSN:2095-1221 2026 年 16 卷 4 期 (227 - 232) ; 2026年8月
  • 收录:
  • 关键词:
  • 摘要:

    目的探讨脑出血后神经损伤修复的关键基因、核心细胞亚群及细胞通讯机制。方法从GEO数据库下载大鼠脑出血转录组数据集GSE288102、小鼠脑出血小胶质细胞转录组数据集GSE266602及小鼠脑出血脑组织单细胞RNA测序数据集GSE167593。采用limma包筛选差异表达基因(DEGs),取两组转录组交集获得共同DEGs;通过DAVID进行GO/KEGG富集分析,STRING构建蛋白互作网络,Cytoscape筛选核心基因;利用Seurat完成单细胞质控、降维、聚类与细胞注释;采用CellChat解析细胞间通讯通路。结果共筛选出96个共同DEGs;GO富集主要集中于免疫细胞活化、白细胞活化及损伤修复相关过程,KEGG富集于ECM受体通路与PI3K-Akt信号通路。筛选出LGALS3、ITGB2、TLR2、TIMP1、FN1、CD44、ICAM1、CCL2、TGFB1、ITGAM共10个关键基因。单细胞RNA分析鉴定出神经元、少突胶质细胞、少突胶质前体细胞、小胶质细胞、星形胶质细胞5类核心细胞群;关键基因在各细胞群呈特异性表达:神经元中LGALS3下调、TGFB1上调;星形胶质细胞中TGFB1、CCL2、ICAM1等上调;小胶质细胞中FN1、TGFB1上调。细胞通讯显示,SPP1- (ITGA5+ITGB1)与SPP1- (ITGAV+ ITGB1)是脑出血后神经修复的核心信号通路。结论本研究明确了脑出血后神经损伤修复10个关键基因、5类关键细胞群及2条核心细胞通讯通路,为脑出血后神经修复机制研究与潜在靶点筛选提供了可靠依据。

  • 推荐引用方式
    GB/T 7714:
    宋海涛,宋仁兴,赵千云, 等. 基于转录组测序和单细胞RNA测序探讨脑出血后神经损伤修复的关键基因和细胞通讯 [J].中华细胞与干细胞杂志(电子版),2026,16(4):227-232.
  • APA:
    宋海涛,宋仁兴,赵千云,聂文,&赵波.(2026).基于转录组测序和单细胞RNA测序探讨脑出血后神经损伤修复的关键基因和细胞通讯 .中华细胞与干细胞杂志(电子版),16(4):227-232.
  • MLA:
    宋海涛, et al. "基于转录组测序和单细胞RNA测序探讨脑出血后神经损伤修复的关键基因和细胞通讯" .中华细胞与干细胞杂志(电子版) 16,4(2026):227-232.
  • 入库时间:
    8/23/2026 10:01:24 PM
  • 更新时间:
    8/23/2026 10:01:24 PM
浏览次数:4 下载次数:0
浏览次数:4
下载次数:0
打印次数:0
浏览器支持: Google Chrome   火狐   360浏览器极速模式(8.0+极速模式) 
返回顶部